Liste des modules partagés

En 2022-2023, les inscriptions aux modules partagés du CHEL[s] pour le 2e semestre seront ouvertes du 18/11 au 05/12 (midi). 

L'offre des modules partagés du 1er semestre sera disponible à partir du 18 novembre. En fonction de la situation sanitaire, les modalités des cours peuvent être amenées à évoluer.

/!\Attention, les étudiants ne peuvent pas demander un module partagé du CHEL[s] au sein de leur établissement d'origine.

NEW : certains modules partagés ont été labelisés dans le cadre du passeport CHEL[s] "Acteurs des transitions". Plus d'informations ici

Pour déposer votre dossier, merci de cliquer sur le bouton vert "s'inscrire" ici à droite, ainsi de bien vouloir envoyer votre CV et votre lettre de motivation à l'adresse suivante :

 
Si vous êtes étudiant.e à l'ENS, l'avis de votre tuteur est obligatoire. Merci de l'envoyer également à chels.modulespartages@gmail.com
 
Merci de nommer les documents avec votre nom et votre prénom svp. 
 
Sans ces éléments, l'équipe CHEL[s] ne pourra pas prendre en compte votre candidature. 
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La liste des modules proposés ci-dessous n'est pas exhaustive. Veuillez consulter le bas de la page pour plus de renseignements. 

Biologie : Architecture et évolution des génomes procaryotes et eucaryotes

Biologie : Architecture et évolution des génomes procaryotes et eucaryotes Image

 

 

♦  Attention : ce cours peut faire partie de l’axe B du Passeport CHEL[s] « Acteurs des Transitions » ♦

Descriptif : Les récents développements des méthodes d’analyse des génomes ont révolutionné notre manière d’aborder la biologie et généré une quantité de données sans précédent sur la structure et la diversité de l’information génétique. Dans le cadre de ce cours, les différentes méthodes d’analyses des génomes seront présentées, en mettant l’accent sur les développements technologiques les plus récents et les applications qui en découlent. Les éléments structuraux des génomes et leur variabilité seront étudiés dans une approche intégrée faisant le lien avec les différents processus biologiques qui les affectent. Les étudiants participeront activement au cours en constituant des dossiers sur les applications et les perspectives de la génomique. Des travaux pratiques sur machine permettront une initiation aux méthodes bioinformatiques d’annotation des séquences génomiques.

Les objectifs de l’UE sont :
1. Approcher les différentes méthodes d’analyse des séquences d’ADN et des génomes et leur évolution, avec une initiation aux méthodes bio-informatiques d’annotation des séquences.
2. Comprendre les différents mécanismes assurant la réplication, la réparation et la recombinaison de l’ADN chez les procaryotes et les eucaryotes.
3. Identifier les différents éléments structuraux constituant les génomes et comprendre leur organisation et leurs interactions.
4. Illustrer la variabilité de l’architecture des génomes en relation avec les processus biologiques affectant l’ADN et les contraintes imposées par l’environnement.
5. Effectuer en groupe un travail de synthèse écrit et une restitution orale sur un sujet imposé lié à la génomique.

Cours magistraux : Cartographie physique et génétique, méthodes de séquençage à haut débit, annotation des génomes, applications de la génomique (médecine, agronomie, etc.). Biologie de l’ADN (réplication, réparation, recombinaison), structure comparative des génomes bactériens et eucaryotes, contenu en bases, gènes à protéines, gènes à ARN, introns, éléments transposables et autres séquences répétées, chromosomes sexuels, etc. Réarrangements génomiques, transfert horizontal, taille des génomes, duplication de gènes et de génomes.
Dossiers présentés par les étudiants : phylogénomique, paléogénomique/ADN ancien, génomique et agronomie, métagénomique, transcriptomique, épigénomique, ingénierie des génomes, génomique et cancer, génomique et maladies génétiques, génomique personnelle : aspects sociétaux.
TD : Réplication, transcription et structure du génome.
TP sur machine : Manipulation de données à haut débit, annotation des génomes.

Les cours auront lieu en présentiel.

Semestre : 2

Créneaux horaires : mardi matin (8h-12h15) ET vendredi après-midi (13h30-17h45), du 11/1/2022 au 4/2/2022.

Nombre total de séances : 30h

Modalités d’évaluation : 3 ECTS

Lieu : site Monod

Page web : lien

Points de contact : delphine.galiana@ens-lyon.fr ; jean-nicolas.volff@ens-lyon.fr

Sous-catégorie:
ENS de Lyon

Biologie : Architecture et évolution des génomes procaryotes et eucaryotes

Biologie : Architecture et évolution des génomes procaryotes et eucaryotes Image

 

 

♦  Attention : ce cours peut faire partie de l’axe B du Passeport CHEL[s] « Acteurs des Transitions » ♦

Descriptif : Les récents développements des méthodes d’analyse des génomes ont révolutionné notre manière d’aborder la biologie et généré une quantité de données sans précédent sur la structure et la diversité de l’information génétique. Dans le cadre de ce cours, les différentes méthodes d’analyses des génomes seront présentées, en mettant l’accent sur les développements technologiques les plus récents et les applications qui en découlent. Les éléments structuraux des génomes et leur variabilité seront étudiés dans une approche intégrée faisant le lien avec les différents processus biologiques qui les affectent. Les étudiants participeront activement au cours en constituant des dossiers sur les applications et les perspectives de la génomique. Des travaux pratiques sur machine permettront une initiation aux méthodes bioinformatiques d’annotation des séquences génomiques.

Les objectifs de l’UE sont :
1. Approcher les différentes méthodes d’analyse des séquences d’ADN et des génomes et leur évolution, avec une initiation aux méthodes bio-informatiques d’annotation des séquences.
2. Comprendre les différents mécanismes assurant la réplication, la réparation et la recombinaison de l’ADN chez les procaryotes et les eucaryotes.
3. Identifier les différents éléments structuraux constituant les génomes et comprendre leur organisation et leurs interactions.
4. Illustrer la variabilité de l’architecture des génomes en relation avec les processus biologiques affectant l’ADN et les contraintes imposées par l’environnement.
5. Effectuer en groupe un travail de synthèse écrit et une restitution orale sur un sujet imposé lié à la génomique.

Cours magistraux : Cartographie physique et génétique, méthodes de séquençage à haut débit, annotation des génomes, applications de la génomique (médecine, agronomie, etc.). Biologie de l’ADN (réplication, réparation, recombinaison), structure comparative des génomes bactériens et eucaryotes, contenu en bases, gènes à protéines, gènes à ARN, introns, éléments transposables et autres séquences répétées, chromosomes sexuels, etc. Réarrangements génomiques, transfert horizontal, taille des génomes, duplication de gènes et de génomes.
Dossiers présentés par les étudiants : phylogénomique, paléogénomique/ADN ancien, génomique et agronomie, métagénomique, transcriptomique, épigénomique, ingénierie des génomes, génomique et cancer, génomique et maladies génétiques, génomique personnelle : aspects sociétaux.
TD : Réplication, transcription et structure du génome.
TP sur machine : Manipulation de données à haut débit, annotation des génomes.

Les cours auront lieu en présentiel.

Semestre : 2

Créneaux horaires : mardi matin (8h-12h15) ET vendredi après-midi (13h30-17h45), du 11/1/2022 au 4/2/2022.

Nombre total de séances : 30h

Modalités d’évaluation : 3 ECTS

Lieu : site Monod

Page web : lien

Points de contact : delphine.galiana@ens-lyon.fr ; jean-nicolas.volff@ens-lyon.fr

La liste des modules proposés ci-dessus n'est pas exhaustive ; vous pouvez consulter et demander d'autres modules partagés ouverts aux étudiants du CHEL[s] aux liens suivants :

Offre de l'ENS de Lyon*

Offre de Sciences Po Lyon

Offre des Mines de Saint-Etienne

Offre du CNSMD de Lyon (disciplines complémentaires)

 

*exemple : ANG-5103

Les 4 premiers caractères correspondent à la discipline du cours (exemple : anglais)

  • Le premier chiffre (milliers) indique le niveau du cours :
    3000 pour les cours niveau L3 et 1e année du Diplôme
    4000 pour les cours de M1+M2
    5000 pour les cours niveau M2
    8000 pour les cours niveau Doctorat
    9000 pour les cours indifférenciés
  • Le deuxième chiffre (centaines) indique le semestre :
    0 pour les cours pouvant avoir lieu soit au S1 soit au S2 selon les années et les intervenants
    1 pour les cours du 1e semestre
    2 pour les cours du 2e semestre
    3 pour les cours annuels

Pour faire votre demande, indiquez "autre module" dans le formulaire d'inscription des modules partagés.